Protein–RNA interactions for Protein: Q92791

P3H4, Endoplasmic reticulum protein SC65, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H4Q92791 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
P3H4Q92791 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P3H4Q92791 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms