Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RABGGTAQ92696 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RABGGTAQ92696 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABGGTAQ92696 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
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