Protein–RNA interactions for Protein: Q92621

NUP205, Nuclear pore complex protein Nup205, humanhuman

Predictions only

Length 2,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP205Q92621 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP205Q92621 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP205Q92621 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms