Protein–RNA interactions for Protein: Q92499

DDX1, ATP-dependent RNA helicase DDX1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX1Q92499 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX1Q92499 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX1Q92499 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX1Q92499 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX1Q92499 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX1Q92499 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX1Q92499 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX1Q92499 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX1Q92499 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX1Q92499 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX1Q92499 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX1Q92499 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX1Q92499 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX1Q92499 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX1Q92499 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX1Q92499 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX1Q92499 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX1Q92499 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX1Q92499 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX1Q92499 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX1Q92499 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX1Q92499 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX1Q92499 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX1Q92499 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX1Q92499 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX1Q92499 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX1Q92499 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX1Q92499 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX1Q92499 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX1Q92499 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX1Q92499 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX1Q92499 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX1Q92499 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX1Q92499 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX1Q92499 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX1Q92499 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX1Q92499 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX1Q92499 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX1Q92499 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX1Q92499 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX1Q92499 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX1Q92499 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX1Q92499 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms