Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWK9

CKAP2, Cytoskeleton-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2Q8WWK9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CKAP2Q8WWK9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CKAP2Q8WWK9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CKAP2Q8WWK9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms