Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW34

TMEM239, Transmembrane protein 239, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM239Q8WW34 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
TMEM239Q8WW34 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM239Q8WW34 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms