Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC107Q8WV48 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC107Q8WV48 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC107Q8WV48 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC107Q8WV48 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC107Q8WV48 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC107Q8WV48 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC107Q8WV48 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC107Q8WV48 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC107Q8WV48 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC107Q8WV48 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC107Q8WV48 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC107Q8WV48 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC107Q8WV48 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC107Q8WV48 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC107Q8WV48 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC107Q8WV48 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC107Q8WV48 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC107Q8WV48 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC107Q8WV48 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC107Q8WV48 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC107Q8WV48 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC107Q8WV48 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC107Q8WV48 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC107Q8WV48 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC107Q8WV48 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC107Q8WV48 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC107Q8WV48 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC107Q8WV48 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC107Q8WV48 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CCDC107Q8WV48 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms