Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD06

AGR3, Anterior gradient protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGR3Q8TD06 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGR3Q8TD06 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGR3Q8TD06 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGR3Q8TD06 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGR3Q8TD06 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGR3Q8TD06 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGR3Q8TD06 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGR3Q8TD06 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGR3Q8TD06 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AGR3Q8TD06 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGR3Q8TD06 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGR3Q8TD06 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGR3Q8TD06 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGR3Q8TD06 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGR3Q8TD06 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGR3Q8TD06 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGR3Q8TD06 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGR3Q8TD06 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGR3Q8TD06 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGR3Q8TD06 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AGR3Q8TD06 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGR3Q8TD06 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGR3Q8TD06 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AGR3Q8TD06 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGR3Q8TD06 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AGR3Q8TD06 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms