Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATL2Q8NHH9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATL2Q8NHH9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms