Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SMG8Q8ND04 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms