Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COLGALT1Q8NBJ5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COLGALT1Q8NBJ5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms