Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ANKRD42Q8N9B4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ANKRD42Q8N9B4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD42Q8N9B4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms