Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00612Q8N6U2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00612Q8N6U2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms