Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC155Q8N6L0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC155Q8N6L0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC155Q8N6L0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms