Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RYBPQ8N488 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RYBPQ8N488 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms