Protein–RNA interactions for Protein: Q8N414

PGBD5, PiggyBac transposable element-derived protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD5Q8N414 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGBD5Q8N414 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGBD5Q8N414 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGBD5Q8N414 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGBD5Q8N414 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PGBD5Q8N414 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PGBD5Q8N414 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGBD5Q8N414 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD5Q8N414 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD5Q8N414 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD5Q8N414 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD5Q8N414 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD5Q8N414 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD5Q8N414 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD5Q8N414 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD5Q8N414 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PGBD5Q8N414 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGBD5Q8N414 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGBD5Q8N414 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGBD5Q8N414 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PGBD5Q8N414 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PGBD5Q8N414 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms