Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2M8

CLASRP, CLK4-associating serine/arginine rich protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLASRPQ8N2M8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLASRPQ8N2M8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLASRPQ8N2M8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CLASRPQ8N2M8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLASRPQ8N2M8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLASRPQ8N2M8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLASRPQ8N2M8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLASRPQ8N2M8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLASRPQ8N2M8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLASRPQ8N2M8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLASRPQ8N2M8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLASRPQ8N2M8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLASRPQ8N2M8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CLASRPQ8N2M8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLASRPQ8N2M8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLASRPQ8N2M8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLASRPQ8N2M8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLASRPQ8N2M8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CLASRPQ8N2M8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLASRPQ8N2M8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLASRPQ8N2M8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLASRPQ8N2M8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLASRPQ8N2M8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLASRPQ8N2M8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLASRPQ8N2M8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLASRPQ8N2M8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLASRPQ8N2M8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLASRPQ8N2M8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLASRPQ8N2M8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLASRPQ8N2M8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLASRPQ8N2M8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLASRPQ8N2M8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLASRPQ8N2M8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLASRPQ8N2M8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLASRPQ8N2M8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms