Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G2

CMTR1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTR1Q8N1G2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CMTR1Q8N1G2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CMTR1Q8N1G2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CMTR1Q8N1G2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CMTR1Q8N1G2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CMTR1Q8N1G2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CMTR1Q8N1G2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CMTR1Q8N1G2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CMTR1Q8N1G2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CMTR1Q8N1G2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CMTR1Q8N1G2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CMTR1Q8N1G2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CMTR1Q8N1G2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CMTR1Q8N1G2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CMTR1Q8N1G2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CMTR1Q8N1G2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CMTR1Q8N1G2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CMTR1Q8N1G2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms