Protein–RNA interactions for Protein: Q8N135

LGI4, Leucine-rich repeat LGI family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI4Q8N135 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGI4Q8N135 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGI4Q8N135 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGI4Q8N135 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGI4Q8N135 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGI4Q8N135 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGI4Q8N135 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGI4Q8N135 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGI4Q8N135 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGI4Q8N135 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGI4Q8N135 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGI4Q8N135 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGI4Q8N135 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGI4Q8N135 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGI4Q8N135 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGI4Q8N135 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGI4Q8N135 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGI4Q8N135 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGI4Q8N135 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGI4Q8N135 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGI4Q8N135 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGI4Q8N135 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGI4Q8N135 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGI4Q8N135 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGI4Q8N135 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGI4Q8N135 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGI4Q8N135 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGI4Q8N135 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGI4Q8N135 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGI4Q8N135 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGI4Q8N135 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGI4Q8N135 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LGI4Q8N135 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LGI4Q8N135 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LGI4Q8N135 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LGI4Q8N135 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LGI4Q8N135 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LGI4Q8N135 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LGI4Q8N135 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LGI4Q8N135 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LGI4Q8N135 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LGI4Q8N135 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LGI4Q8N135 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LGI4Q8N135 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LGI4Q8N135 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LGI4Q8N135 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LGI4Q8N135 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LGI4Q8N135 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LGI4Q8N135 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LGI4Q8N135 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LGI4Q8N135 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LGI4Q8N135 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LGI4Q8N135 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LGI4Q8N135 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LGI4Q8N135 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LGI4Q8N135 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LGI4Q8N135 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LGI4Q8N135 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LGI4Q8N135 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LGI4Q8N135 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LGI4Q8N135 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LGI4Q8N135 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LGI4Q8N135 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LGI4Q8N135 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LGI4Q8N135 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LGI4Q8N135 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LGI4Q8N135 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LGI4Q8N135 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LGI4Q8N135 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LGI4Q8N135 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LGI4Q8N135 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LGI4Q8N135 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LGI4Q8N135 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LGI4Q8N135 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LGI4Q8N135 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LGI4Q8N135 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LGI4Q8N135 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LGI4Q8N135 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LGI4Q8N135 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LGI4Q8N135 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LGI4Q8N135 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LGI4Q8N135 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LGI4Q8N135 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LGI4Q8N135 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LGI4Q8N135 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LGI4Q8N135 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LGI4Q8N135 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LGI4Q8N135 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LGI4Q8N135 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LGI4Q8N135 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LGI4Q8N135 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LGI4Q8N135 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LGI4Q8N135 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LGI4Q8N135 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LGI4Q8N135 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LGI4Q8N135 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LGI4Q8N135 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LGI4Q8N135 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LGI4Q8N135 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LGI4Q8N135 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms