Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLF2Q8IX21 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLF2Q8IX21 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLF2Q8IX21 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms