Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWL2

SFTPA1, Pulmonary surfactant-associated protein A1, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPA1Q8IWL2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SFTPA1Q8IWL2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFTPA1Q8IWL2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms