Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVD9

NUDCD3, NudC domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD3Q8IVD9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NUDCD3Q8IVD9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NUDCD3Q8IVD9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms