Protein–RNA interactions for Protein: Q86YT6

MIB1, E3 ubiquitin-protein ligase MIB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIB1Q86YT6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIB1Q86YT6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIB1Q86YT6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIB1Q86YT6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIB1Q86YT6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIB1Q86YT6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MIB1Q86YT6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIB1Q86YT6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIB1Q86YT6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIB1Q86YT6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MIB1Q86YT6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MIB1Q86YT6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MIB1Q86YT6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MIB1Q86YT6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MIB1Q86YT6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MIB1Q86YT6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MIB1Q86YT6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MIB1Q86YT6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MIB1Q86YT6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MIB1Q86YT6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MIB1Q86YT6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MIB1Q86YT6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MIB1Q86YT6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MIB1Q86YT6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MIB1Q86YT6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MIB1Q86YT6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MIB1Q86YT6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MIB1Q86YT6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIB1Q86YT6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIB1Q86YT6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIB1Q86YT6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIB1Q86YT6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MIB1Q86YT6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MIB1Q86YT6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MIB1Q86YT6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MIB1Q86YT6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MIB1Q86YT6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MIB1Q86YT6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MIB1Q86YT6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms