Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT4

TRIM50, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM50, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM50Q86XT4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM50Q86XT4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM50Q86XT4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRIM50Q86XT4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRIM50Q86XT4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM50Q86XT4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM50Q86XT4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM50Q86XT4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM50Q86XT4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM50Q86XT4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms