Protein–RNA interactions for Protein: Q86WN2

IFNE, Interferon epsilon, humanhuman

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNEQ86WN2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNEQ86WN2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNEQ86WN2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNEQ86WN2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNEQ86WN2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNEQ86WN2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNEQ86WN2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNEQ86WN2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNEQ86WN2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNEQ86WN2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNEQ86WN2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNEQ86WN2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNEQ86WN2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNEQ86WN2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNEQ86WN2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNEQ86WN2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNEQ86WN2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNEQ86WN2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNEQ86WN2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNEQ86WN2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNEQ86WN2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNEQ86WN2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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