Protein–RNA interactions for Protein: Q86UG4

SLCO6A1, Solute carrier organic anion transporter family member 6A1, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO6A1Q86UG4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLCO6A1Q86UG4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLCO6A1Q86UG4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLCO6A1Q86UG4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLCO6A1Q86UG4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLCO6A1Q86UG4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLCO6A1Q86UG4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLCO6A1Q86UG4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLCO6A1Q86UG4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLCO6A1Q86UG4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO6A1Q86UG4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO6A1Q86UG4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO6A1Q86UG4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO6A1Q86UG4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO6A1Q86UG4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO6A1Q86UG4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO6A1Q86UG4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO6A1Q86UG4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO6A1Q86UG4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO6A1Q86UG4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO6A1Q86UG4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO6A1Q86UG4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO6A1Q86UG4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO6A1Q86UG4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO6A1Q86UG4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO6A1Q86UG4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLCO6A1Q86UG4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO6A1Q86UG4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO6A1Q86UG4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO6A1Q86UG4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO6A1Q86UG4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO6A1Q86UG4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO6A1Q86UG4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO6A1Q86UG4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO6A1Q86UG4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO6A1Q86UG4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO6A1Q86UG4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO6A1Q86UG4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO6A1Q86UG4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLCO6A1Q86UG4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms