Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNF554Q86TJ5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF554Q86TJ5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms