Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMC6Q7Z403 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMC6Q7Z403 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms