Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CATSPER4Q7RTX7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CATSPER4Q7RTX7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms