Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
HECW1Q76N89 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC35.36■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC35.35■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.34■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC35.34■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
HECW1Q76N89 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC35.31■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
HECW1Q76N89 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms