Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP34Q70CQ2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
USP34Q70CQ2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP34Q70CQ2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP34Q70CQ2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP34Q70CQ2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP34Q70CQ2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP34Q70CQ2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP34Q70CQ2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP34Q70CQ2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP34Q70CQ2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP34Q70CQ2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP34Q70CQ2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP34Q70CQ2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP34Q70CQ2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP34Q70CQ2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP34Q70CQ2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP34Q70CQ2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP34Q70CQ2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP34Q70CQ2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP34Q70CQ2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP34Q70CQ2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP34Q70CQ2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP34Q70CQ2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP34Q70CQ2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP34Q70CQ2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms