Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CCDC141Q6ZP82 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC141Q6ZP82 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms