Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYNE3Q6ZMZ3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYNE3Q6ZMZ3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SYNE3Q6ZMZ3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNE3Q6ZMZ3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNE3Q6ZMZ3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNE3Q6ZMZ3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNE3Q6ZMZ3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNE3Q6ZMZ3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYNE3Q6ZMZ3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNE3Q6ZMZ3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNE3Q6ZMZ3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNE3Q6ZMZ3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNE3Q6ZMZ3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNE3Q6ZMZ3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SYNE3Q6ZMZ3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNE3Q6ZMZ3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNE3Q6ZMZ3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNE3Q6ZMZ3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNE3Q6ZMZ3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNE3Q6ZMZ3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNE3Q6ZMZ3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNE3Q6ZMZ3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNE3Q6ZMZ3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNE3Q6ZMZ3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNE3Q6ZMZ3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNE3Q6ZMZ3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNE3Q6ZMZ3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYNE3Q6ZMZ3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms