Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM72Q6ZMU5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM72Q6ZMU5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM72Q6ZMU5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM72Q6ZMU5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM72Q6ZMU5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM72Q6ZMU5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM72Q6ZMU5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM72Q6ZMU5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM72Q6ZMU5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM72Q6ZMU5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM72Q6ZMU5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM72Q6ZMU5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM72Q6ZMU5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM72Q6ZMU5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM72Q6ZMU5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM72Q6ZMU5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms