Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUC0

TFAP2E, Transcription factor AP-2-epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2EQ6VUC0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAP2EQ6VUC0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAP2EQ6VUC0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAP2EQ6VUC0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAP2EQ6VUC0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAP2EQ6VUC0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAP2EQ6VUC0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAP2EQ6VUC0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAP2EQ6VUC0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAP2EQ6VUC0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAP2EQ6VUC0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAP2EQ6VUC0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAP2EQ6VUC0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAP2EQ6VUC0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAP2EQ6VUC0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAP2EQ6VUC0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAP2EQ6VUC0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAP2EQ6VUC0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAP2EQ6VUC0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAP2EQ6VUC0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAP2EQ6VUC0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAP2EQ6VUC0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAP2EQ6VUC0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAP2EQ6VUC0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAP2EQ6VUC0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TFAP2EQ6VUC0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TFAP2EQ6VUC0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TFAP2EQ6VUC0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TFAP2EQ6VUC0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TFAP2EQ6VUC0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TFAP2EQ6VUC0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TFAP2EQ6VUC0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms