Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXX9

RSPO2, R-spondin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO2Q6UXX9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RSPO2Q6UXX9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RSPO2Q6UXX9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms