Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWM7

LCTL, Lactase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCTLQ6UWM7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LCTLQ6UWM7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LCTLQ6UWM7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms