Protein–RNA interactions for Protein: Q6UUV7

CRTC3, CREB-regulated transcription coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTC3Q6UUV7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRTC3Q6UUV7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRTC3Q6UUV7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRTC3Q6UUV7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms