Protein–RNA interactions for Protein: Q6UB35

MTHFD1L, Monofunctional C1-tetrahydrofolate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1LQ6UB35 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTHFD1LQ6UB35 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTHFD1LQ6UB35 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTHFD1LQ6UB35 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTHFD1LQ6UB35 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MTHFD1LQ6UB35 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MTHFD1LQ6UB35 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MTHFD1LQ6UB35 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MTHFD1LQ6UB35 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTHFD1LQ6UB35 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTHFD1LQ6UB35 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTHFD1LQ6UB35 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTHFD1LQ6UB35 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTHFD1LQ6UB35 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTHFD1LQ6UB35 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTHFD1LQ6UB35 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTHFD1LQ6UB35 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTHFD1LQ6UB35 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTHFD1LQ6UB35 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTHFD1LQ6UB35 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTHFD1LQ6UB35 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTHFD1LQ6UB35 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTHFD1LQ6UB35 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTHFD1LQ6UB35 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTHFD1LQ6UB35 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTHFD1LQ6UB35 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTHFD1LQ6UB35 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTHFD1LQ6UB35 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTHFD1LQ6UB35 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTHFD1LQ6UB35 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTHFD1LQ6UB35 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTHFD1LQ6UB35 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTHFD1LQ6UB35 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTHFD1LQ6UB35 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms