Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4A7

SFXN4, Sideroflexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN4Q6P4A7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SFXN4Q6P4A7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SFXN4Q6P4A7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SFXN4Q6P4A7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SFXN4Q6P4A7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SFXN4Q6P4A7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SFXN4Q6P4A7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SFXN4Q6P4A7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFXN4Q6P4A7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFXN4Q6P4A7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFXN4Q6P4A7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFXN4Q6P4A7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFXN4Q6P4A7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SFXN4Q6P4A7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFXN4Q6P4A7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFXN4Q6P4A7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SFXN4Q6P4A7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFXN4Q6P4A7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFXN4Q6P4A7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFXN4Q6P4A7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFXN4Q6P4A7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFXN4Q6P4A7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFXN4Q6P4A7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFXN4Q6P4A7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFXN4Q6P4A7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SFXN4Q6P4A7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFXN4Q6P4A7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFXN4Q6P4A7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFXN4Q6P4A7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFXN4Q6P4A7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SFXN4Q6P4A7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms