Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 TAF1D-218ENST00000533794 505 ntTSL 20.4□□□□□ -2.359e-14■■■■■ 48.6
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PRPF8Q6P2Q9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.122e-10■■■■■ 48.2
PRPF8Q6P2Q9 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.642e-10■■■■■ 48.2
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PRPF8Q6P2Q9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.134e-7■■■■■ 48.1
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PRPF8Q6P2Q9 PRR5-204ENST00000403696 789 ntTSL 320.82■□□□□ 0.922e-7■■■■■ 48.1
PRPF8Q6P2Q9 RABGGTB-208ENST00000471759 2137 ntTSL 24.43□□□□□ -1.73e-7■■■■■ 48.1
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