Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KANK3Q6NY19 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KANK3Q6NY19 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KANK3Q6NY19 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KANK3Q6NY19 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms