Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHBDD2Q6NTF9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RHBDD2Q6NTF9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHBDD2Q6NTF9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHBDD2Q6NTF9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHBDD2Q6NTF9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RHBDD2Q6NTF9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHBDD2Q6NTF9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHBDD2Q6NTF9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RHBDD2Q6NTF9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHBDD2Q6NTF9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHBDD2Q6NTF9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHBDD2Q6NTF9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RHBDD2Q6NTF9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHBDD2Q6NTF9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHBDD2Q6NTF9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHBDD2Q6NTF9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHBDD2Q6NTF9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHBDD2Q6NTF9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RHBDD2Q6NTF9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHBDD2Q6NTF9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RHBDD2Q6NTF9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHBDD2Q6NTF9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RHBDD2Q6NTF9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms