Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT80Q6KB66 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT80Q6KB66 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203 ms