Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RCSD1Q6JBY9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RCSD1Q6JBY9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms