Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SDE2Q6IQ49 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDE2Q6IQ49 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms