Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.38
CARMIL2Q6F5E8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
CARMIL2Q6F5E8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CARMIL2Q6F5E8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
CARMIL2Q6F5E8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CARMIL2Q6F5E8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CARMIL2Q6F5E8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CARMIL2Q6F5E8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CARMIL2Q6F5E8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CARMIL2Q6F5E8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CARMIL2Q6F5E8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CARMIL2Q6F5E8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CARMIL2Q6F5E8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CARMIL2Q6F5E8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CARMIL2Q6F5E8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CARMIL2Q6F5E8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CARMIL2Q6F5E8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CARMIL2Q6F5E8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CARMIL2Q6F5E8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CARMIL2Q6F5E8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CARMIL2Q6F5E8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CARMIL2Q6F5E8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CARMIL2Q6F5E8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CARMIL2Q6F5E8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CARMIL2Q6F5E8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
CARMIL2Q6F5E8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CARMIL2Q6F5E8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CARMIL2Q6F5E8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CARMIL2Q6F5E8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CARMIL2Q6F5E8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CARMIL2Q6F5E8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CARMIL2Q6F5E8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CARMIL2Q6F5E8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CARMIL2Q6F5E8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CARMIL2Q6F5E8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CARMIL2Q6F5E8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CARMIL2Q6F5E8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CARMIL2Q6F5E8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CARMIL2Q6F5E8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms