Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SUMO4Q6EEV6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SUMO4Q6EEV6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms