Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATL3Q6DD88 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATL3Q6DD88 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms