Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ANKRD40Q6AI12 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ANKRD40Q6AI12 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ANKRD40Q6AI12 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms